详细说明
针对种属:mouse
质粒由来源于 GeCKO (v2)库的cadherin-1620 nt向导RNA组成。
向导RNA指导Cas9蛋白去诱导基因组DNA中的位点专一的双链破裂(DSB)
基因的敲除或者激活可以使用 cadherin-16 Antibody (E-7): sc-393153分析
除慢病毒激活颗粒外,其他产品均为转染即用型纯化DNA质粒。慢病毒激活颗粒预包被成慢病毒颗粒的形式,适用于难被转染的细胞
CRISPR/Cas9 KO Plasmid
Description
20 µg 纯化的即用型的质粒DNA,最多可供20次转染
为保证最大敲除效率,cadherin-16 CRISPR/Cas9 敲除质粒 (m) 包含三个质粒,每个质粒都编码Cas9 核酶和 cadherin-16-特异性20nt向导RNA.
gRNA 序列来源于 GeCKO (v2)文库,指导Cas9蛋白去诱导基因组DNA双链中一个特异位点的断裂。
如果需要筛选Cas9成功诱导双链断裂的细胞,推荐用 cadherin-16 HDR质粒(m) (sc-419591-HDR) 共转染。
转染后,基因敲除效率可以用抗体:cadherin-16: sc-393153,通过WB, IF或者IHC分析
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HDR Plasmid
Description
20 µg 纯化的即用型的质粒DNA,最多可供20次转染
推荐用 cadherin-16 HDR 质粒 (m) 和 cadherin-16 CRISPR/Cas9 KO 质粒 (m) CRISPR/Cas9敲除质粒共转染 (m)
cadherin-16 HDR 质粒 (m) 包含2-3种质粒,每一种都含有一个同源介导的双链DNA修复(HDR)模板,与 cadherin-16 CRISPR/Cas9 KO 质粒 (m) 的剪切位点相对应
每个HDR质粒包含两个800个bp同源臂,可特异地结合到相应的Cas9诱导的双链DNA破坏位点附近的基因组DNA
每个HDR质粒中嵌入了一个嘌呤霉素抗性基因,从而能筛选出稳定敲除(KO)细胞,以及一个RFP(红色荧光蛋白)基因,可用于观察验证转染情况
嘌呤霉素抗性基因和红色荧光蛋白基因的两侧是两个LoxP位点,以便与接下来的Cre Vector sc-418923处理
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Double Nickase Plasmids
Description
20 µg 纯化的即用型的质粒DNA,最多可供20次转染
cadherin-16 双切口酶质粒(m)含有一对质粒,分别编码D10A突变的Cas9核酸酶,和目标特异的 20 nt 向导RNA (gRNA),与其相应的cadherin-16 CRISPR/Cas9敲除质粒相比,它在基因敲除方面具有更好的特异性
成对的向导RNA序列与目标基因中约20个碱基对互补,从而使Cas9可以模仿DNA双链断裂(DSB),介导特异的基因组DNA双切割
质粒对中的一个包含供筛选使用的嘌呤霉素抗性基因;另一个包含供观察转染使用的绿色荧光蛋白标记
cadherin-16双切口酶质粒(m2)编码的成对的向导RNA与cadherin-16双切口酶质粒(m)的编码的向导RNA不同
转染后,基因敲除效率可以用抗体:cadherin-16: sc-393153,通过WB, IF或者IHC分析
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CRISPR Activation Plasmids
Description
20 µg 纯化的即用型的质粒DNA,最多可供20次转染
cadherin-16 CRISPER激活质粒(m)是一种协同激活介质(SAM)转录激活系统,目的在于特定上调基因表达
cadherin-16 CRISPR激活质粒(m)包含三种质量比为1:1:1的质粒:一种质粒编码去活化的Cas9 (dCas9)核酸酶(D10A and N863A),它融合了转录活化域VP64和杀稻瘟菌素抗性基因;一种质粒编码MS2-p65-HSF1融合蛋白和潮霉素抗性基因;一种质粒编码目标特定的20 nt向导RNA和嘌呤霉素抗性基因
形成的SAM复合物结合到转录起始位点上游大约200-250 nt的特定位点区域,为高效激活基因提供转录因子的招募
cadherin-16 CRISPR激活质粒(m2)中编码特异目标的 20 nt 向导RNA的单链 gRNA (MS2) 质粒不同于cadherin-16CRISPR激活质粒(m)的gRNA
转染后,基因激活效率可以用抗体:cadherin-16 Antibody (E-7): sc-393153,通过WB、IF或IHC分析
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Lentiviral Activation Particles
Description
200 µl 高滴度即用型CRISPR/dCas9慢病毒激活粒子
cadherin-16 慢病毒激活颗粒(m)是一种协同激活介质(SAM)转录激活系统,通过细胞慢病毒转导,特异高效地上调目的基因的表达
cadherin-16慢病毒激活颗粒(m)包含以下SAM激活元素:一种是去活化的Cas9 (dCas9)核酸酶(D10A and N863A),它融合了转录活化域VP64;一种是MS2-p65-HSF1融合蛋白;一种是目标特定的20 nt向导RNA。它们还含有杀稻瘟菌素,潮霉素和嘌呤霉素抗性基因
一经转导,形成的SAM复合物结合到转录起始位点上游大约200-250 nt的特定位点区域,为高效激活基因,招募转录因子
cadherin-16 慢病毒激活颗粒(m2)中编码的特异目标的 20 nt 向导RNA的gRNA不同于cadherin-16慢病毒激活颗粒(m)中编码的gRNA
转染后,基因激活效率可以用抗体:cadherin-16 Antibody (E-7): sc-393153,通过WB、IF或IHC分析
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